|
|
| عنوان
(عنوانها): |
ارزيابي تنوع ژنتيكي برخي ژنوتيپ هاي چمني Festuca rubra L. با استفاده از نشانگر هاي ريزماهواره
|
| نویسنده
(نویسنده ها): |
كرباسي زاده، زهرا |
| همکاران: |
محمدي، رضا (مشاور علمی)
خيام نكويي، مجتبي (مشاور علمی)
كافي، محسن (راهنمای پایان نامه) |
| گرایش: |
دانشگاه تهران . پرديس كشاورزي و منابع طبيعي . دانشكده علوم باغباني و گياه پزشكي . رشته علوم باغباني |
| مقطع
تحصیلی: |
کارشناسی ارشد |
| تاریخ
دفاع: |
1388/12/10 |
| برساخت: |
83 ص.:
جدول ، نمودار ، تصویر |
| زبان
اثر: |
فارسی |
| نوع پایان
نامه: |
|
| شماره
ثبت: |
3998 |
| شماره
بازیابی: |
3998 |
| محلهای
نگه داری: |
- كتابخانه مركزي پرديس كشاورزي و منابع طبيعي (ثبت: 3998 بازیابی: 3998)
- كتابخانه مركزي -تالار اطلاع رساني (ثبت: 45004) |
| چکیده
(فارسی): |
با هدف بررسي تنوع ژنتيكي 36 نمونه ژنوتيپ فستوكاي قرمز موجود در كلكسيون پژوهشكده بيوتكنولوژي كشاورزي منطقه مركزي كشور، نشانگرهاي ريزماهواره مناسب براي گونه فستوكاي قرمز "Festuca rubra " از ميان 155 آغازگر EST-SSR و 511 جفت آغازگر Genomic-SS اختصاصي گونه F. arundinacea با توجه به مقالات علمي موجود بررسي شدند. بر اساس نحوه تكثير و سطح چندشكلي گزارش شده در مقالات، مجموعه اي متشكل از 21 جفت آغازگر ريزماهواره EST و 19 جفت آغازگر Genomic براي بررسي انتخاب و سنتز شد. از 40 جفت آغازگر بررسي شده، 34 جفت آغازگر در تمام يا تعدادي از ژنوتيپ هاي فستوكاي قرمز تكثير نشان دادند و 29 جفت آغازگر داراي تكثير مناسب، به عنوان جفت آغازگرهاي داراي انتقال پذيري مناسب شناخته شده و براي بررسي چندشكلي انتخاب شدند. از 29 جفت آغازگر انتقال پذير، 18 جفت آغازگر از نوع EST-SSR بوده و 11 جفت آغازگر ديگر Genomic-SSR بودند. همچنين پس از بررسي چندشكلي جفت آغازگرها، با حذف آغازگرهايي كه يا قادر به انجام تكثير نبودند و يا باندهاي اضافي ايجاد مي كردند، تعداد 15 جفت آغازگر ضمن تكثير موفق، الگوي باندي چندشكل را روي نمونه¬هاي فستوكاي قرمز نشان دادند و 66 آلل چند شكل را با ميانگين 4/4 جفت آلل چندشكل به ازاي هر جفت آغازگر را تكثير نمودند. بر اين اساس هر چند ريزماهواره هاي EST-SSR، از انتقال پذيري بيشتري نسبت به انواع Genomic-SSR برخوردار بودند (%86 در برابر %55)، اما ميزان چندشكلي در انواع Genomic-SSR بيش از EST-SSR بود (%64 در برابر %44). پس از بررسي تنوع ژنتيكي، 36 ژنوتيپ مورد مطالعه فستوكاي قرمز ضمن ارائه سطوح مناسبي از تنوع ژنتيكي، در دسته هاي مجزايي و با مطابقت نسبي با منشأ جغرافي شان گروه بندي شدند. بر اين اساس، جمعيت همدان از بيشترين فاصله ژنتيكي با سايرين برخوردار بود و جمعيت هاي مجاري Veszto و Derekegyhaz كمترين فاصله ژنتيكي با يكديگر را داشتند. در مجموع، مجموعه ريزماهواره هاي معرفي شده، ابزار كارامد و مناسبي را براي مطالعه مولكولي گياهان فستوكاي قرمز بدست دادندكه مي تواند براي مديريت مؤثر ژرم پلاسم، تسريع و كنترل پروژه هاي اصلاحي و همچنين مطالعه اكولوژي و ژنتيك آن مورد استفاده قرار گيرند. |
| چکیده
(انگلیسی): |
Aimed to assess the genetic diversity in 36 genotypes of red fescue collection allocated at Agricultural Biotechnology Research Institute Central Region of Iran (ABRICI) and introduction of suitable microsatellite markers for Festuca rubra L. species, 155 EST-SSR markers and 511 Genomic-SSR primer pairs specific for species F. arundinacea available at scientific articles were evaluated. Based on the Mode of reproduction and the level of polymorphism reported in the papers, a set of 21 EST and 19 genomic microsatellites were synthesized for review and selection. From the 40 primer pairs, 34 were amplified in all or some genotypes of red fescue and 29 of them with appropriate amplification were selected for review as transferable primer pairs. From 29 transferable SSRs, 18 were EST-SSR and remaining was Genomic-SSR. Also, after review of polymorphic primers, and eliminating of some not amplified or monomorphic primers, a set of 15 primer pairs was selected. These selected primer pairs were successfully amplified and resulted in polymorphic banding pattern comprising of 66 polymorphic alleles with the average 4.4 per primer pair. Although EST-SSRs, showed more transferability than Genomic-SSRs (86% versus 55%), but the rate of Genomic-SSR polymorphism was higher in comparison to EST-SSRs (64% versus 44%). After studying genetic diversity, 36 studied genotypes of red fescue were separately clustered with relatively consistent with the geography of their origin. On this basis, the population of Hamadan had the most genetic distance to others and two Hungarian populations (Derekegyhaz and Veszto) had the lowest genetic distances. In general, resulted microsatellites in this research were identified as appropriate and efficient tool for molecular studies of red fescue and could be effectively used for germplasm management, to accelerate breeding projects and improve their control ecology and genetic studies. |
| ذخیره: |
فایل 15 صفحه اول،
فایل تمام صفحه ها |
|
|
|
|
|
|
|
|
|